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深圳首例H5N6流感病例病毒基因確定

發(fā)布時(shí)間:2016-1-4 14:33:49??????瀏覽次數(shù):

南方日報(bào)訊 2015年12月29日,深圳市報(bào)告了1例H5N6流感病例。1月3日,筆者從深圳市疾控中心獲悉,經(jīng)全基因組序列分析結(jié)果顯示,目前深圳活禽市場外環(huán)境存在H5N6流感病毒,本次報(bào)告病例的病毒與活禽市場外環(huán)境的病毒高度同源,從生物信息學(xué)角度證實(shí)本次病例是因接觸活禽或市場外環(huán)境感染的。

  此次報(bào)告的H5N6流感病例為深圳首例,全球第五例H5N6流感病例。病例出現(xiàn)后,深圳市疾控中心與華大基因合作,立即對患者咽拭子樣本和活禽市場外環(huán)境樣本分離出的H5N6流感病毒進(jìn)行基因測序。經(jīng)過晝夜奮戰(zhàn),1月3日上午10時(shí),完成了全基因組序列分析。

  基因測序結(jié)果顯示,患者樣本中H5N6病毒HA、NA基因與2014年廣東省從鴨只中分離的H5N6病毒高度同源,同源性>98%;與深圳2014年活禽市場外環(huán)境分離出的H5N6病毒高度同源,同源性>98%;與深圳2015年12月份來自外環(huán)境標(biāo)本分離出的3株H5N6病毒高度同源。

  同時(shí),患者樣本中H5N6病毒HA、NA基因與2014年四川和廣東報(bào)告的2例H5N6流感病例的病毒高度同源,同源性>98%?;颊邩颖局蠬5N6病毒的內(nèi)部6個(gè)基因與本地外環(huán)境中H9N2病毒高度同源,H9N2病毒為該病毒的內(nèi)部骨架供體。患者樣本中H5N6病毒HA和NA基因分別來源于外環(huán)境中的H5N1病毒和H6N6病毒。

  經(jīng)過測序分析認(rèn)為,目前深圳活禽市場外環(huán)境存在H5N6流感病毒,本次報(bào)告病例的病毒與活禽市場外環(huán)境的病毒高度同源,從生物信息學(xué)角度證實(shí)本次病例是因接觸活禽或市場外環(huán)境感染的。因此,減少人與活禽密切接觸的機(jī)會,可有效預(yù)防人感染H5N6流感。其中一個(gè)重要的措施是切實(shí)推行活禽集中屠宰、冷鏈配送、生鮮上市。該措施在國際上被普遍認(rèn)可,發(fā)達(dá)國家在上世紀(jì)二三十年代就開始推廣禽類生鮮上市,目前,歐美、日本等發(fā)達(dá)國家和我國港澳地區(qū)已實(shí)行生鮮禽類代替活禽上市。對于市民,需要做到盡量不直接接觸和處理活禽,不食用病死禽,不購買來源不明的禽鳥類產(chǎn)品。

  此外,深圳市疾控中心也發(fā)現(xiàn)感染人的基因來源比較復(fù)雜,至少經(jīng)歷H5N1流感病毒與H6N6流感病毒的重配,然后重配的H5N6流感病毒再與H9N2流感病毒重配,產(chǎn)生目前感染人的H5N6流感病毒。具體的病毒重配過程,還在深入研究中。

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